Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brcc3P46737 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brcc3P46737 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms