Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

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Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsfP46460 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NsfP46460 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsfP46460 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsfP46460 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsfP46460 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsfP46460 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsfP46460 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsfP46460 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsfP46460 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsfP46460 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsfP46460 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsfP46460 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsfP46460 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsfP46460 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsfP46460 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsfP46460 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NsfP46460 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsfP46460 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsfP46460 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsfP46460 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsfP46460 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsfP46460 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsfP46460 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsfP46460 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsfP46460 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsfP46460 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsfP46460 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsfP46460 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsfP46460 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsfP46460 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsfP46460 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsfP46460 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsfP46460 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsfP46460 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsfP46460 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsfP46460 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsfP46460 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsfP46460 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NsfP46460 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NsfP46460 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms