Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlx1P43345 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms