Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox15P43267 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox15P43267 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms