Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sept1P42209 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept1P42209 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept1P42209 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept1P42209 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept1P42209 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept1P42209 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sept1P42209 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept1P42209 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sept1P42209 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms