Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl28P41105 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl28P41105 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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