Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VhlP40338 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VhlP40338 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VhlP40338 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VhlP40338 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VhlP40338 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VhlP40338 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VhlP40338 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VhlP40338 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VhlP40338 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms