Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ThpoP40226 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ThpoP40226 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ThpoP40226 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ThpoP40226 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms