Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf2P39429 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf2P39429 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf2P39429 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf2P39429 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf2P39429 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf2P39429 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf2P39429 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf2P39429 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms