Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AboP38649 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AboP38649 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AboP38649 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AboP38649 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AboP38649 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AboP38649 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AboP38649 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AboP38649 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AboP38649 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AboP38649 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AboP38649 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AboP38649 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AboP38649 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AboP38649 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AboP38649 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AboP38649 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AboP38649 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AboP38649 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AboP38649 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms