Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtlP38585 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtlP38585 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtlP38585 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TtlP38585 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtlP38585 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtlP38585 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtlP38585 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtlP38585 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtlP38585 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtlP38585 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtlP38585 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TtlP38585 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtlP38585 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtlP38585 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtlP38585 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtlP38585 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtlP38585 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtlP38585 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtlP38585 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtlP38585 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtlP38585 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtlP38585 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtlP38585 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TtlP38585 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtlP38585 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TtlP38585 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TtlP38585 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TtlP38585 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TtlP38585 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TtlP38585 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TtlP38585 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TtlP38585 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TtlP38585 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TtlP38585 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TtlP38585 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TtlP38585 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TtlP38585 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TtlP38585 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TtlP38585 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TtlP38585 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TtlP38585 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TtlP38585 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TtlP38585 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms