Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sar1aP36536 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1aP36536 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms