Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tfap2aP34056 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tfap2aP34056 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tfap2aP34056 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms