Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnar1P33896 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifnar1P33896 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms