Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc5P32043 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms