Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccnd3P30282 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms