Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprmP28828 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprmP28828 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprmP28828 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprmP28828 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprmP28828 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprmP28828 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprmP28828 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprmP28828 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprmP28828 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprmP28828 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprmP28828 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprmP28828 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprmP28828 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprmP28828 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprmP28828 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
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