Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd10P28359 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxd10P28359 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd10P28359 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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