Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa5P28312 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa5P28312 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms