Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjc1P28229 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms