Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav1P27870 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav1P27870 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms