Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl6P27784 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl6P27784 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms