Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2afxP27661 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afxP27661 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afxP27661 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afxP27661 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afxP27661 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afxP27661 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
H2afxP27661 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2afxP27661 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2afxP27661 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2afxP27661 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afxP27661 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afxP27661 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2afxP27661 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afxP27661 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afxP27661 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afxP27661 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2afxP27661 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2afxP27661 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2afxP27661 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2afxP27661 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2afxP27661 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2afxP27661 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2afxP27661 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H2afxP27661 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2afxP27661 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2afxP27661 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2afxP27661 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2afxP27661 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2afxP27661 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2afxP27661 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2afxP27661 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms