Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpbP27048 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpbP27048 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SnrpbP27048 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpbP27048 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpbP27048 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpbP27048 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpbP27048 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms