Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tln1P26039 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tln1P26039 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tln1P26039 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tln1P26039 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tln1P26039 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tln1P26039 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tln1P26039 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms