Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmo2P25801 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo2P25801 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmo2P25801 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo2P25801 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo2P25801 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo2P25801 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo2P25801 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo2P25801 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo2P25801 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo2P25801 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo2P25801 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo2P25801 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo2P25801 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms