Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf2P23906 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf2P23906 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf2P23906 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf2P23906 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf2P23906 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf2P23906 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf2P23906 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf2P23906 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf2P23906 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms