Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdm2P23804 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdm2P23804 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdm2P23804 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdm2P23804 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdm2P23804 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mdm2P23804 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mdm2P23804 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mdm2P23804 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms