Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SagP20443 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SagP20443 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SagP20443 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SagP20443 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SagP20443 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SagP20443 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SagP20443 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SagP20443 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SagP20443 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SagP20443 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SagP20443 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SagP20443 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SagP20443 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SagP20443 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SagP20443 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SagP20443 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SagP20443 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SagP20443 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SagP20443 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SagP20443 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SagP20443 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SagP20443 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SagP20443 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SagP20443 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SagP20443 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SagP20443 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SagP20443 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SagP20443 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SagP20443 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SagP20443 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SagP20443 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SagP20443 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SagP20443 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SagP20443 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SagP20443 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SagP20443 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SagP20443 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SagP20443 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SagP20443 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SagP20443 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SagP20443 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SagP20443 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SagP20443 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SagP20443 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SagP20443 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SagP20443 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SagP20443 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SagP20443 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SagP20443 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SagP20443 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SagP20443 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SagP20443 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SagP20443 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SagP20443 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SagP20443 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SagP20443 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SagP20443 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SagP20443 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SagP20443 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SagP20443 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SagP20443 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SagP20443 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SagP20443 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SagP20443 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SagP20443 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms