Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TP20293 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TP20293 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TP20293 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TP20293 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TP20293 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TP20293 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TP20293 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TP20293 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TP20293 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TP20293 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TP20293 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TP20293 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TP20293 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TP20293 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TP20293 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TP20293 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TP20293 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TP20293 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TP20293 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP20293 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP20293 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP20293 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP20293 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP20293 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP20293 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP20293 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP20293 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TP20293 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms