Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou5f1P20263 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou5f1P20263 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou5f1P20263 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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