Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ms4a1P19437 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a1P19437 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms