Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RargP18911 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RargP18911 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RargP18911 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RargP18911 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RargP18911 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RargP18911 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RargP18911 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RargP18911 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RargP18911 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RargP18911 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RargP18911 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RargP18911 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RargP18911 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RargP18911 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RargP18911 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RargP18911 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RargP18911 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RargP18911 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RargP18911 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RargP18911 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RargP18911 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RargP18911 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RargP18911 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RargP18911 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RargP18911 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RargP18911 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RargP18911 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RargP18911 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RargP18911 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RargP18911 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RargP18911 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RargP18911 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RargP18911 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RargP18911 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RargP18911 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RargP18911 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RargP18911 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RargP18911 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RargP18911 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RargP18911 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RargP18911 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RargP18911 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RargP18911 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RargP18911 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RargP18911 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RargP18911 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RargP18911 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RargP18911 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms