Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka1P18653 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms