Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcl9P18340 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxcl9P18340 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl9P18340 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms