Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tgfb3P17125 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgfb3P17125 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms