Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sptan1P16546 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms