Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcna1P16388 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcna1P16388 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcna1P16388 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms