Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30aP15533 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim30aP15533 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30aP15533 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms