Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irf1P15314 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf1P15314 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf1P15314 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms