Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms