Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctla2aP12399 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctla2aP12399 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctla2aP12399 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctla2aP12399 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctla2aP12399 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctla2aP12399 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctla2aP12399 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctla2aP12399 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctla2aP12399 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms