Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd1d1P11609 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd1d1P11609 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd1d1P11609 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms