Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl3P10855 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl3P10855 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms