Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc6P10629 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc6P10629 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms