Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd4P10628 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms