Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
P10404 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P10404 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P10404 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P10404 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P10404 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P10404 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P10404 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P10404 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P10404 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P10404 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P10404 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P10404 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P10404 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P10404 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P10404 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P10404 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P10404 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P10404 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms