Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolP10400 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolP10400 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolP10400 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolP10400 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolP10400 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolP10400 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolP10400 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolP10400 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PolP10400 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PolP10400 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PolP10400 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PolP10400 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PolP10400 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PolP10400 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PolP10400 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PolP10400 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolP10400 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolP10400 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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