Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxb4P10284 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb4P10284 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb4P10284 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms