Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem254aP0DN89 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem254aP0DN89 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms